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【研究成果】メタゲノム解析で発熱性尿路感染症の病原体を特定

2026年8月7日

Bio2Qの研究者らによって共同執筆され、学術誌『Journal of Infection』に掲載された本研究は、事前に行われた抗生物質投与によって従来の尿培養検査では原因菌が特定できない発熱性尿路感染症(fUTI)に対し、メタゲノムシーケンシングが有効な診断ツールとなることを実証したものです。研究者らは血流感染が確認されたfUTI患者の尿検体を解析し、培養が陰性となった症例の大部分においても病原体の高精度な特定に成功しました。本成果は、従来法で診断困難だった培養陰性の尿路感染症における新たな補完的診断法を確立し、精密な抗菌薬療法の実現に貢献する可能性を示したものです。

タイトル Metagenomic sequencing as a diagnostic tool for urine culture negative febrile urinary tract infection
著者 V A Janes1, J E Stalenhoef2, B C L van der Putten3, L A M Koster4, M E Jakobs4, J T van Dissel5, M D de Jong3, C Schultsz6, D R Mende7
簡単な説明
Bio2QとAmsterdam UMCの両機関の研究者が共同で実施した本研究は、ショットガン・メタゲノムシーケンシングが、抗菌薬投与後であっても有熱性尿路感染症(fUTI)の原因病原体を特定することにより、従来の尿培養が抱える大きな限界を克服できることを実証しています。
有熱性尿路感染症(fUTI)の診断は通常、尿培養に依存しています。しかし、検体採取前に抗菌薬が投与されると、細菌の増殖が抑制されることが多く、その結果、臨床医は微生物学的な確認を得ることや、原因病原体を標的とした治療方針を決定することが困難になります。そこで本研究の研究者らは、血流感染が確認されたfUTI患者を対象として、尿検体にメタゲノムシーケンシングを適用し、培養陽性および培養陰性の双方の尿検体における感染病原体の検出能を評価しました。この手法により、抗菌薬の事前投与後に尿培養が陰性となった患者の大部分を含め、圧倒的多数の症例において原因病原体を特定することに成功しました。シーケンシングデータに基づく抗菌薬耐性の予測については、治療方針の決定に確実に活用できるようにするため、さらなる改良が必要です。しかし、本研究で開発された手法は、従来の培養法では病原体を検出できない場合であっても、病原体の同定に極めて有効であることが証明されました。
本研究は、メタゲノムシーケンシングが、事前に抗菌薬が投与されていた場合でも、臨床的に重要な病原体を同定できることを実証しました。これにより、本技術は、培養陰性の尿路感染症に対する有望な補完的診断法として確立されるとともに、より精密な抗菌薬治療を実現するためのツールとなる可能性が示されました。
DOI 10.1016/j.jinf.2026.106783
雑誌名 Journal of Infection
巻号ページ Volume 93, Issue 2
出版年月日 2026年8月

Affiliations

1 Amsterdam UMC, University of Amsterdam, Department of Medical Microbiology, Amsterdam, Netherlands; Department of Medical Microbiology, Central Bacteriology and Serology Laboratory, Tergooi Medical Centre, Hilversum, Netherlands. Electronic address: v.a.janes@amsterdamumc.nl.
2 Department of Internal Medicine and Infectious Diseases, OLVG, Amsterdam, Netherlands.
3 Amsterdam UMC, University of Amsterdam, Department of Medical Microbiology, Amsterdam, Netherlands.
4 Amsterdam UMC, University of Amsterdam, Clinical Genetics, Core Facility Genomics, Amsterdam, Netherlands.
5 Department of Infectious Diseases, Leiden University Medical Centre, Leiden, Netherlands.
6 Amsterdam UMC, University of Amsterdam, Department of Medical Microbiology, Amsterdam, Netherlands; Amsterdam UMC, University of Amsterdam, Department of Global Health, Amsterdam Institute for Global Health and Development (AIGHD), Amsterdam, Netherlands.
7 Amsterdam UMC, University of Amsterdam, Department of Medical Microbiology, Amsterdam, Netherlands; Human Biology-Microbiome-Quantum Research Center (WPI-Bio2Q), Keio University, Tokyo, Japan. 

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