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研究者紹介 – Dr. Daniel Richard Mende

2025年2月14日

Bio-1コアのPIとしてDaniel Richard Mendeが着任しました。

ご挨拶

「私の研究は、ヒトマイクロバイオームを構成する微生物群集の仕組みと、宿主および環境との相互作用を理解することを目標としています。この目標を達成するため、計算ツールを用いて、大規模なオミクスデータの処理・解析を行っています。研究対象は、遺伝子機能や進化レベルから、微生物群集全体の相互作用に至るまで、多岐にわたります。

ドイツ・ハイデルベルクの欧州分子生物学研究所(EMBL: European Molecular Biology Laboratory)での博士課程では、新しいツールやデータベースを開発し、それらを活用してマイクロバイオームを分析・理解する研究を行っていました。研究の中心はヒトマイクロバイオームですが、ポスドク時代に取り組んだ海洋微生物群集の研究を通して学んだ、生態学的・生理学的な考え方も多く取り入れています。

Bio2Qに着任する前は、アムステルダム大学医療センター(Amsterdam University Medical Centers)で計算生物学研究グループを率い、オランダ、ガーナ、ザンビアなど、由来が異なるコホートから得られたメタゲノムシーケンスデータの解析に取り組んでいました。特に、抗生物質使用がマイクロバイオームに与える影響の解明は、アムステルダムでの研究の重要なテーマでした。

Bio2Qでのビジョンは、(メタ)ゲノミクス、メタボロミクス、(メタ)トランスクリプトミクスなどのマルチオミクスデータを、微生物の特性、進化の視点、メカニズムに基づく知識と統合し、健康と疾患におけるマイクロバイオームの機能をより深く理解することです。この研究は、遺伝子・ゲノム・分子のアノテーションから始まり、機械学習やAIを駆使して、大規模データを統合・解析し、異なるコホートや研究レベルを横断して進めていきます。

この挑戦は、学際的なチームによってこそ実現できるものです。私はBio2Q内の多様な分野の研究者と協力し、この目標を達成したいと考えています。また、私たちの研究成果をBio2Q内だけでなく、広範な研究コミュニティとも共有し、マイクロバイオーム研究のさらなる発展を促進していきたいと考えています。

私たちは成長中の研究グループです。最先端のマイクロバイオーム研究に興味を持つ新しいポスドクおよび大学院生を歓迎いたします。」

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2026.11.12

長期リサーチインターンシップ生紹介 – Kevin Deesyさん

このたびBio2Qでは、新しく長期リサーチインターンシップ生としてKevin Deesyさんを迎えました。 ご挨拶 「Bio2Qチームの皆様、 私はKevin Deesyと申します。現在、Technical University of Munich (TUM)で持続可能な食を専攻し、分子生物工学と微生物学を専門として修士課程を修了しようとしています。これまで、ドイツやシンガポールの研究室で研究を行ってきましたが、このたび慶應義塾大学で研究を続けられることを大変楽しみにしています。 今後10ヶ月間、私はブロックマン博士の研究室に所属し、まずは研究インターンシップを経て、その後...

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2026.11.10

研究者紹介 - Dr. Augustinas Silale

Bio-2 コアのJr. PIとしてDr. Augustinas Silaleが着任しました。 ご挨拶 「Bio2Qコミュニティの皆さん、こんにちは!私の名前はAugustinas (August) Silaleです。リトアニア出身です。Bio2QにJr. PIとして参加できることを大変嬉しく思っています。 University of Cambridgeでは自然科学を専攻しました。学士課程(BA)の卒業研究では、Sir Tom Blundell教授の研究グループでフラグメントベース創薬に取り組み、そこで実践的な構造生物学の魅力を味わいました。修士課程(MSci)では、MRC La...

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2026.11.09

WPI 20周年記念シンポジウム「世界トップレベル研究拠点の20年、その先へ―」開催・Bio2Qブース出展のお知らせ

2027年1月24日(日)、パシフィコ横浜 ノースにて、文部科学省および独立行政法人日本学術振興会(JSPS)主催の「WPI 20周年記念シンポジウム」が開催されます(オンライン配信あり)。 本シンポジウムは、世界トップレベル研究拠点プログラム(WPI)の20年の歩みを振り返り、卓越した基礎研究の未来や社会からの期待を議論する記念イベントです。 当日は、ノーベル賞受賞者による対談や若手拠点長による講演、パネルディスカッションなどに加え、全国18のWPI拠点によるブース出展が行われます。 慶應義塾大学ヒト生物学-微生物叢-量子計算研究センター(WPI-Bio2Q)も会場内にブースを出展し、最新...

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2026.11.09

リサーチ・アドミニストレーター (URA) 募集

Bio2Qでは、自由な発想で主体性を持ってBio2Q関連研究を強力に推進する方を、リサーチ・アドミニストレーター(URA)(特任助教または特任講師)として募集します。 詳細につきましては、以下のリンクよりご確認ください。皆様のご応募をお待ちしております。   募集要項 → https://bio2q.keio.ac.jp/wp-content/uploads/3_URA.pdf

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2026.11.06

研究者紹介 - Dr. Seongmoon Jo

Bio-2 コアのポスドク研究員としてDr. Seongmoon Joが着任しました。 ご挨拶 「こんにちは。私はSeongmoon Joと申します。Bio2QのNadinath Nillegoda教授の研究室にポスドク研究員として加わることができ、大変うれしく思います。韓国のYonsei Universityで医学博士号を取得し、以前はセントルイスにあるWashington Universityでポスドク研究員として勤務しておりました。私の研究経歴は、幹細胞生物学、造血、神経科学、および疾患モデリングなど多岐にわたります。また幹細胞由来のオルガノイドシステムや、さまざまな生体内実...